防御生物攻擊（第Ⅱ卷）

目錄
第1章嗜神經(jīng)病毒1
1.1引言1
1.2蟲媒病毒2
1.2.1甲病毒2
1.2.2黃病毒6
1.2.3亨尼帕病毒11
1.2.4狂犬病毒屬13
1.3小結(jié)15
參考文獻(xiàn)16
第2章人類病毒性出血熱概述22
2.1引言22
2.1.1沙粒病毒科31
2.1.2布尼亞病毒33
2.1.3絲狀病毒科35
2.1.4黃病毒科35
2.2生物防御注意事項(xiàng)37
參考文獻(xiàn)40
第3章天花病毒：臨床癥狀、分子生物學(xué)以及生物恐怖主義前景56
3.1引言56
3.2生物戰(zhàn)和生物恐怖主義問(wèn)題57
3.3病毒學(xué)59
3.3.1分類59
3.3.2形態(tài)59
3.3.3基因組59
3.3.4生命周期60
3.3.5生命周期：穿入60
3.3.6生命周期：早期基因表達(dá)62
3.3.7生命周期：DNA復(fù)制62
3.3.8生命周期：中晚期基因表達(dá)、形態(tài)發(fā)生和傳播63
3.4天花臨床癥狀63
3.4.1重型天花的臨床分類64
3.4.2輕型天花的臨床分類66
3.5天花的致病機(jī)制66
3.5.1病毒侵入和感染67
3.5.2病毒傳播67
3.5.3臨床和解剖病理學(xué)68
3.5.4天花在動(dòng)物體內(nèi)的致病機(jī)制69
3.6診斷72
3.6.1臨床診斷72
3.6.2實(shí)驗(yàn)室診斷73
3.7預(yù)防73
3.7.1第一代疫苗 74
3.7.2第二代疫苗76
3.7.3第三代疫苗78
3.7.4第四代疫苗79
3.7.5口服和滅活疫苗80
3.7.6全球天花疫苗儲(chǔ)備 81
3.8治療82
3.8.1概述82
3.8.2被動(dòng)免疫82
3.8.3DNA合成抑制劑82
3.8.4病毒成熟抑制藥83
3.8.5病毒釋放抑制劑83
3.8.6宿主定向藥物以及其他藥物83
3.8.7預(yù)防和治療：未來(lái)方向84
3.9總結(jié)/結(jié)論84
參考文獻(xiàn)86
第4章病毒治療學(xué)104
4.1引言104
4.2核酸合成的抑制劑106
4.3最近批準(zhǔn)藥物和用于預(yù)防可能造成嚴(yán)重后果的病毒感染臨時(shí)使用藥物 108
4.4病毒附著宿主細(xì)胞膜和膜受體抑制物與細(xì)胞進(jìn)入抑制物109
4.5RNA沉默與反義寡聚物治療110
4.6磷酸二酯嗎啉低聚物（PMO）111
4.7針對(duì)出血性疾病成分111
4.8免疫療法111
4.9未來(lái)發(fā)展方向112
參考文獻(xiàn)113
第5章炭疽芽孢桿菌生物威脅劑的挑戰(zhàn)117
5.1引言117
5.2診斷（臨床）120
5.3治療 122
5.4流行病學(xué)和環(huán)境診斷學(xué)125
5.5洗消和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估128
5.6法醫(yī)學(xué) 130
5.7媒體與公共關(guān)系132
5.8物質(zhì)133
5.9結(jié)論134
參考文獻(xiàn)136
第6章布魯氏菌：潛在的生物威脅因子141
6.1引言141
6.2微生物學(xué)特征142
6.3布魯氏菌：一種生物威脅制劑143
6.4布魯氏菌病是一種人畜共患的疾病146
6.5人布魯氏菌病的臨床表現(xiàn)148
6.6布魯氏菌病的診斷和治療151
6.7生物技術(shù)在布魯氏菌檢測(cè)和鑒定中的應(yīng)用154
6.8預(yù)防控制156
參考文獻(xiàn)159
第7章鼻疽伯克氏菌和鼻疽病164
7.1鼻疽病的歷史164
7.1.1鼻疽伯克霍爾德菌和鼻疽病的歷史164
7.1.2歷史的視角：作為生物武器的鼻疽伯克氏菌165
7.2致病機(jī)制166
7.2.1黏附和侵襲166
7.2.2分泌167
7.2.3群體感應(yīng)效應(yīng)（QS）169
7.2.4自體轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白169
7.3流行病學(xué)170
7.3.1宿主170
7.3.2感染源和傳播源170
7.3.3發(fā)生的事件170
7.4治療和疫苗172
7.4.1抗生素治療和新的治療方法172
7.4.2疫苗173
7.4.3全細(xì)胞疫苗173
7.4.4亞單位疫苗175
7.5診斷方法176
7.5.1血清學(xué)檢測(cè)176
7.5.2PCR檢測(cè)178
7.5.3新的診斷方法179
7.6結(jié)論性意見179
參考文獻(xiàn)181
第8章類鼻疽伯克氏菌191
8.1引言191
8.2歷史192
8.2.1首次報(bào)告的案例192
8.2.2屬的變化193
8.3流行病學(xué)193
8.3.1空間分布194
8.4傳播方式194
8.4.1皮膚接觸傳播195
8.4.2消化道攝入195
8.4.3呼吸道吸入196
8.4.4其他傳播途徑196
8.5臨床表現(xiàn)196
8.5.1臨床癥狀和轉(zhuǎn)歸196
8.5.2病理生理學(xué)199
8.6疾病的分子層面201
8.6.1基因組島（GI）和原噬菌體201
8.6.2菌落形態(tài)學(xué)202
8.6.3抗生素耐藥性203
8.6.4莢膜多糖（CPS）203
8.7發(fā)病機(jī)制204
8.7.1細(xì)胞黏附和侵襲204
8.7.2分泌系統(tǒng)：第三型和第六型205
8.8生物恐怖和生物戰(zhàn)的應(yīng)對(duì)措施206
8.8.1生物威脅206
8.8.2應(yīng)對(duì)措施207
參考文獻(xiàn)209
第9章貝氏柯克斯體：隱藏在眼前221
9.1引言221
9.1.1歷史意義221
9.1.2貝氏柯克斯體（C.burnetii）222
9.1.3培養(yǎng)不可培養(yǎng)物：貝氏柯克斯體研究的重大進(jìn)展223
9.2將“疑問(wèn)”從Q熱中剝離出來(lái)223
9.2.1人感染的流行病學(xué)223
9.2.2傳播224
9.2.3臨床特征225
9.2.4診斷226
9.2.5治療方法227
9.3貝氏柯克斯體的胞內(nèi)生活：貝氏柯克斯體空泡（CCV）的特征228
9.3.1侵入和細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸228
9.3.2貝氏柯克斯體空泡的擴(kuò)張230
9.3.3抗凋亡的特點(diǎn)230
9.4貝氏柯克斯體的致病機(jī)制研究231
9.4.1感染的實(shí)驗(yàn)室模型231
9.4.2尋找細(xì)菌毒力因子231
9.4.3IVB型分泌系統(tǒng)Dot/Icm：一個(gè)重要的毒力因素232
9.4.4識(shí)別IV型分泌系統(tǒng)的底物233
9.4.5闡明效應(yīng)物的功能233
9.5展望：貝氏柯克斯體——值得關(guān)注的原因？235
參考文獻(xiàn)236
第10章土拉弗朗西斯菌：兔熱病原體和生物恐怖劑252
10.1引言252
10.2自然傳播周期和感染途徑252
10.3流行病學(xué)、檢測(cè)和治療254
10.4細(xì)胞內(nèi)生命周期257
10.5宿主免疫反應(yīng)258
10.6宿主的代謝反應(yīng)259
10.7結(jié)論259
參考文獻(xiàn)261
第11章鼠疫耶爾森菌265
11.1引言265
11.2病原體特征265
11.3病理生理學(xué)266
11.4臨床特征和潛伏期266
11.4.1肺鼠疫266
11.5感染的途徑268
11.6臨床表現(xiàn)268
11.6.1腺鼠疫269
11.6.2肺鼠疫270
11.7實(shí)驗(yàn)室診斷271
11.7.1樣品采集272
11.7.2樣品包裝272
11.7.3實(shí)驗(yàn)室檢查272
11.8鼠疫的病例定義274
11.9鼠疫的臨床管理274
11.9.1引言274
11.9.2支持治療274
11.9.3特定的抗生素治療275
11.9.4暴露后預(yù)防276
11.9.5尸體管理276
11.10醫(yī)護(hù)人員防護(hù)277
11.10.1通用預(yù)防措施277
11.10.2選擇個(gè)人防護(hù)裝備277
11.10.3實(shí)驗(yàn)室的保護(hù)措施278
11.10.4消毒和洗消278
11.10.5廢物管理279
參考文獻(xiàn)280
第12章細(xì)菌治療學(xué)284
12.1β內(nèi)酰胺類抗生素和干擾細(xì)胞壁合成的抗生素286
12.2原核細(xì)胞蛋白質(zhì)合成抑制劑287
12.2.1抗分枝桿菌劑：安莎霉素（利福霉素）288
12.3氟喹諾酮類藥物288
12.4氨基香豆素289
12.5葉酸合成抑制劑289
12.5.1磺胺類藥物289
12.5.2二氨基芐基嘧啶290
12.6生物戰(zhàn)或生物恐怖關(guān)注的細(xì)菌制劑感染免疫療法290
參考文獻(xiàn)292
第13章生物威脅劑分子診斷方法的進(jìn)展294
13.1引言294
13.2新型診斷技術(shù)295
13.2.1免疫學(xué)方法295
13.2.2生物傳感器297
13.2.3基于核酸擴(kuò)增的技術(shù)299
13.2.4二代測(cè)序301
13.2.5微陣列304
13.2.6等溫?cái)U(kuò)增305
13.2.7微流控312
13.3總結(jié)313
參考文獻(xiàn)314
第14章二代測(cè)序在食源性微生物病原體檢測(cè)中的應(yīng)用329
14.1引言329
14.2二代測(cè)序：背景和歷史330
14.3測(cè)序的核心內(nèi)容332
14.3.1基因組大小和GC含量高低332
14.3.2覆蓋范圍333
14.3.3準(zhǔn)確性335
14.4短讀長(zhǎng)測(cè)序335
14.5長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序337
14.6使用二代測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行病原體檢測(cè)339
14.7測(cè)序數(shù)據(jù)在病原體檢測(cè)中的應(yīng)用342
14.7.1公共衛(wèi)生環(huán)境下的腸道沙門氏菌342
14.7.2WGS和專業(yè)流行病學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)實(shí)現(xiàn)更高分辨率的病原體分型342
14.7.3沙門氏菌血清分型和通過(guò)PCR推斷沙門氏菌血清分型344
14.7.4通過(guò)WGS拼接預(yù)測(cè)沙門氏菌血清型344
14.7.5NGS數(shù)據(jù)通?？梢约涩F(xiàn)有的基于等位基因PCR分型方案344
14.7.6WGS是一種無(wú)與倫比的高分辨率細(xì)菌分型工具345
14.7.7WGS、公共數(shù)據(jù)庫(kù)和生物信息學(xué)為發(fā)現(xiàn)假定的毒力因子提供了新的方法346
14.7.8WGS在研究由兩種血清型組成的雜交型肉毒毒素中的作用346
14.7.9通過(guò)核苷酸/蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)發(fā)現(xiàn)新的肉毒桿菌神經(jīng)毒素血清型347
14.7.10梭狀芽孢桿菌屬以外細(xì)菌中肉毒毒素樣蛋白的鑒定348
14.8總結(jié)348
參考文獻(xiàn)350
第15章生物毒素作為生物威脅劑的概述357
15.1引言357
15.2生物毒素是中間譜制劑358
15.3生物毒素應(yīng)對(duì)委員會(huì)和機(jī)構(gòu)360
15.4生物毒素的分類362
15.4.1動(dòng)物毒液362
15.4.2細(xì)菌毒素363
15.4.3海洋毒素365
15.4.4真菌毒素366
15.4.5植物毒素367
15.5總結(jié)368
參考文獻(xiàn)369
第16章農(nóng)業(yè)生物恐怖379
16.1引言379
16.2生物武器攻擊的原因379
16.3生物武器發(fā)展或攻擊農(nóng)業(yè)目標(biāo)的歷史382
16.4食物途徑385
16.5攻擊方式387
16.5.1作物387
16.5.2家畜388
16.5.3非國(guó)家行為的生物恐怖主義389
16.5.4基因工程389
16.6檢測(cè)模式390
16.7農(nóng)業(yè)目標(biāo)的脆弱性因素390
16.8非標(biāo)準(zhǔn)攻擊模型392
16.8.1生物巡航392
16.8.2對(duì)生物燃料作物的攻擊393
16.8.3引入物種的使用393
16.9對(duì)策394
16.9.1檢測(cè)394
16.9.2加強(qiáng)農(nóng)業(yè)機(jī)構(gòu)、其他聯(lián)邦機(jī)構(gòu)和軍方之間合作和溝通的建議396
16.9.3基因工程397
16.9.4先進(jìn)農(nóng)業(yè)技術(shù)397
16.10總結(jié)398
參考文獻(xiàn)399