十六元大環(huán)內(nèi)酯查爾霉素和阿德加霉素的生物合成機(jī)制研究

1 緒論     001
1.1十六元大環(huán)內(nèi)酯類抗生素的生物合成研究現(xiàn)狀    002
1.2糖的生物合成及在天然產(chǎn)物改造中的應(yīng)用研究現(xiàn)狀    015
2 Streptomyces sp.HK-2006-1主要代謝產(chǎn)物分離鑒定及遺傳轉(zhuǎn)移系統(tǒng)的建立     034
2.1Streptomyces sp.HK-2006-1主要代謝產(chǎn)物分離鑒定    035
2.2Streptomyces sp.HK-2006-1遺傳轉(zhuǎn)移系統(tǒng)的建立    043
2.3小結(jié)    046
3 阿德加霉素和查爾霉素生物合成基因簇的鑒定及邊界的確定     048
3.1阿德加霉素類化合物和查爾霉素類化合物由同一基因簇合成    049
3.2全基因組測序    051
3.3基因簇邊界的確定    055
3.4小結(jié)    059
4 阿德加霉素和查爾霉素生物合成基因簇基因功能分析及生物合成途徑推測     060
4.1阿德加霉素類化合物和查爾霉素類化合物聚酮母核生物合成途徑推測    061
4.2內(nèi)酯環(huán)骨架后修飾推測    063
4.3脫氧糖生物合成途徑推測    064
4.4脫氧糖與大環(huán)內(nèi)酯母核組裝    067
4.5阿德加霉素和查爾霉素合成相關(guān)調(diào)節(jié)基因和抗性基因    068
4.6小結(jié)    069
5 阿德加霉素和查爾霉素生物合成基因簇中關(guān)鍵基因的功能研究     070
5.1阿德加霉素和查爾霉素生物合成分支基因的確定    071
5.2查爾糖3-酮基還原基因的確定    076
5.3糖基轉(zhuǎn)移酶基因almTⅠ的敲除驗(yàn)證    078
5.4小結(jié)    080
6 查爾糖3位甲基化酶的鑒定與功能研究     082
6.1查爾糖3位甲基化基因的確定    083
6.2查爾糖3位甲基化酶基因almCⅡ功能的體外研究    091
6.3新產(chǎn)化合物7和8的抗菌活性檢測    097
6.4小結(jié)    098
7 阿德加糖碳酸酯生物合成機(jī)制研究     102
7.1阿德加糖五元碳酸酯環(huán)的形成是一種后修飾作用    103
7.2喂養(yǎng)實(shí)驗(yàn)鎖定與阿德加糖五元碳酸酯環(huán)形成相關(guān)的基因范圍    104
7.3與五元碳酸酯環(huán)形成相關(guān)的基因的敲除驗(yàn)證    106
7.4阿德加糖五元碳酸酯環(huán)生物合成相關(guān)基因底物喂養(yǎng)實(shí)驗(yàn)    112
7.5S.coelicolor系統(tǒng)：免疫共沉淀驗(yàn)證蛋白復(fù)合體    114
7.6pTNT/S.lividans——蛋白質(zhì)高表達(dá)系統(tǒng)    116
7.7化合物9的分離及結(jié)構(gòu)鑒定    129
7.8小結(jié)    132
附錄     135
參考文獻(xiàn)     148