單細(xì)胞測序方法和應(yīng)用

目錄
第1章 單細(xì)胞測序在未來醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用 1
一、單細(xì)胞研究 1
二、單細(xì)胞測序的臨床應(yīng)用意義 1
三、基本操作流程 3
四、與傳統(tǒng)的基因芯片技術(shù)方法的比較 4
五、機(jī)遇與挑戰(zhàn) 5
六、小結(jié) 5
第2章 超級細(xì)胞模型在單細(xì)胞表型分類中的應(yīng)用 6
一、超級細(xì)胞模型及其發(fā)展 6
二、單細(xì)胞研究面臨的挑戰(zhàn) 6
三、超級細(xì)胞模型 9
四、實(shí)例解析：超級細(xì)胞模型在單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序中的應(yīng)用 12
五、小結(jié) 15
第3章 微生物單細(xì)胞基因組分析 17
一、微生物與非可培養(yǎng)微生物類群 17
二、單細(xì)胞基因組分析的基本方法 17
三、全基因組擴(kuò)增的技術(shù)方法 19
四、單細(xì)胞全基因組測序應(yīng)用于不可培養(yǎng)微生物的研究 21
五、小結(jié) 22
第4章 單細(xì)胞測序在動態(tài)轉(zhuǎn)錄組中的應(yīng)用 23
一、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組動態(tài)分析的應(yīng)用價(jià)值 23
二、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序的基本原理和步驟 24
三、用于單細(xì)胞測序的微流體裝置的開發(fā) 26
四、RNA測序方法的基本步驟 27
五、已發(fā)表的單細(xì)胞 RNA測序方法及比較 29
六、分析單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中的生物信息學(xué)挑戰(zhàn) 36
七、單細(xì)胞 RNA測序的應(yīng)用 36
八、小結(jié) 37
第5章 系統(tǒng)免疫學(xué)在樹突狀細(xì)胞代謝研究中的應(yīng)用 38
一、系統(tǒng)免疫學(xué)簡介 38
二、樹突狀細(xì)胞代謝調(diào)控的研究進(jìn)展 40
三、DC代謝調(diào)控中的系統(tǒng)免疫學(xué) 41
四、展望 42
第6章 系統(tǒng)免疫學(xué)及調(diào)節(jié)性T淋巴細(xì)胞研究 43
一、調(diào)節(jié)性T細(xì)胞概述 43
二、系統(tǒng)生物學(xué)技術(shù)在Treg領(lǐng)域的應(yīng)用 47
三、展望 51
第7章 幼淋巴細(xì)胞-淋巴細(xì)胞與生物信息學(xué) 52
一、幼淋巴細(xì)胞特性 52
二、幼淋巴細(xì)胞的蛋白組學(xué) 53
三、幼淋巴細(xì)胞的基因組學(xué) 54
四、幼淋巴細(xì)胞與白血病 56
五、白血病特異性生物標(biāo)志物 57
六、展望 57
第8章 淋巴細(xì)胞在肝癌中的作用及其治療利用 58
一、肝癌及其發(fā)病機(jī)制研究進(jìn)展 58
二、肝癌中的TIL亞群 60
三、基于TIL的肝癌治療 62
四、采用高通量技術(shù)研究肝癌淋巴細(xì)胞 64
五、肝癌中的網(wǎng)絡(luò)化調(diào)控和個(gè)體化治療 67
六、小結(jié) 67
第9章 肝細(xì)胞壞死的早期生物標(biāo)志物 69
一、肝細(xì)胞死亡 69
二、凋亡和壞死生物標(biāo)志物 70
三、微小核糖核苷酸（microRNA） 72
四、線粒體損傷生物標(biāo)志物 72
五、炎癥生物標(biāo)志物 73
六、DNA損傷生物標(biāo)志物 73
七、小結(jié) 74
第10章 基于流式細(xì)胞儀的單個(gè)細(xì)胞分選實(shí)驗(yàn)步驟 75
一、單細(xì)胞的流式細(xì)胞儀分選 75
二、實(shí)驗(yàn)步驟 76
三、小結(jié) 78
第11章 分離肺癌單細(xì)胞 80
一、單細(xì)胞技術(shù)和組學(xué)科學(xué) 80
二、單細(xì)胞分離技術(shù) 81
三、口吸管顯微操作試驗(yàn)方案 81
四、小結(jié) 82
第12章 腫瘤生物信息學(xué) 86
第13章 單細(xì)胞異質(zhì)性檢測在腫瘤中的應(yīng)用 88
一、單細(xì)胞異質(zhì)性在腫瘤診斷及治療中的臨床意義 88
二、單細(xì)胞異質(zhì)性的檢測對象 89
三、單細(xì)胞異質(zhì)性檢測方法 92
四、小結(jié) 94
參考文獻(xiàn) 95