芽胞桿菌 第四卷 芽胞桿菌脂肪酸組學(xué)

目錄
**章 緒論 1
**節(jié) 微生物脂肪酸組 1
一、微生物脂質(zhì)組 1
二、微生物脂肪酸組概述 6
三、微生物脂肪酸組特性 8
四、微生物脂肪酸組應(yīng)用 16
第二節(jié) 微生物脂肪酸組學(xué)研究進(jìn)展 20
一、脂肪酸組學(xué)在亞熱帶植被土壤微生物群落研究中的應(yīng)用 20
二、脂肪酸組學(xué)在濕地土壤微生物群落研究中的應(yīng)用 32
三、脂肪酸組學(xué)在施肥影響土壤微生物群落研究中的應(yīng)用 38
四、脂肪酸組學(xué)在耕作方式影響土壤微生物群落研究中的應(yīng)用 47
五、脂肪酸組學(xué)在長(zhǎng)期定位觀察站土壤微生物群落多樣性研究中的應(yīng)用 52
六、脂肪酸組學(xué)在入侵生物影響土壤微生物群落研究中的應(yīng)用 57
七、脂肪酸組學(xué)在養(yǎng)殖發(fā)酵床微生物群落研究中的應(yīng)用 62
第三節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組學(xué)研究進(jìn)展 65
一、脂肪酸組學(xué)在芽胞桿菌系統(tǒng)分類上的應(yīng)用 65
二、脂肪酸組學(xué)在工業(yè)芽胞桿菌種類鑒定中的應(yīng)用 67
三、脂肪酸組學(xué)在作物內(nèi)生芽胞桿菌種類鑒定中的應(yīng)用 68
四、脂肪酸組學(xué)在土壤環(huán)境芽胞桿菌鑒定中的應(yīng)用 70
五、脂肪酸組學(xué)在植物病害芽胞桿菌生防菌鑒定中的應(yīng)用 73
六、脂肪酸組學(xué)在物質(zhì)轉(zhuǎn)化芽胞桿菌鑒定中的應(yīng)用 74
七、脂肪酸組學(xué)在芽胞桿菌發(fā)酵研究中的應(yīng)用 76
八、脂肪酸組學(xué)在芽胞桿菌物質(zhì)代謝研究中的應(yīng)用 81
第二章 芽胞桿菌脂肪酸組測(cè)定與分析 85
**節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組測(cè)定方法 85
一、芽胞桿菌脂肪酸組測(cè)定原理 85
二、芽胞桿菌脂肪酸組測(cè)定 86
三、典型芽胞桿菌脂肪酸組測(cè)定 92
第二節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組比較 107
一、芽胞桿菌脂肪酸組差異 107
二、芽胞桿菌脂肪酸組統(tǒng)計(jì) 127
三、典型芽胞桿菌脂肪酸組分區(qū)特征 137
第三節(jié) 測(cè)定條件對(duì)芽胞桿菌脂肪酸測(cè)定的影響 142
一、提取條件對(duì)芽胞桿菌脂肪酸測(cè)定的影響 142
二、獲菌量對(duì)芽胞桿菌脂肪酸測(cè)定的影響 147
三、培養(yǎng)溫度對(duì)芽胞桿菌脂肪酸測(cè)定的影響 164
四、培養(yǎng)時(shí)間對(duì)芽胞桿菌脂肪酸測(cè)定的影響 172
五、培養(yǎng)基對(duì)芽胞桿菌脂肪酸測(cè)定的影響 181
六、芽胞桿菌脂肪酸鑒定的可靠性 191
第四節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸數(shù)值分析 203
一、芽胞桿菌與非芽胞桿菌的脂肪酸特征分析 203
二、芽胞桿菌脂肪酸組比例與脂肪酸總量的關(guān)系 216
三、芽胞桿菌菌體濃度與脂肪酸總量的關(guān)系 226
四、芽胞桿菌主要脂肪酸占整體脂肪酸的比例 231
第三章 芽胞桿菌脂肪酸組生物學(xué)特性 235
**節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組與生物學(xué)特性的測(cè)定 235
一、概述 235
二、研究方法 237
三、芽胞桿菌脂肪酸組測(cè)定 241
四、芽胞桿菌pH適應(yīng)范圍測(cè)定 253
五、芽胞桿菌溫度適應(yīng)范圍測(cè)定 257
六、芽胞桿菌鹽分適應(yīng)范圍測(cè)定 261
七、芽胞桿菌生理生化指標(biāo)測(cè)定 265
八、討論 271
第二節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組與生長(zhǎng)繁殖的相關(guān)性 274
一、概述 274
二、研究方法 274
三、芽胞桿菌脂肪酸組與培養(yǎng)時(shí)間的相關(guān)性 274
四、芽胞桿菌脂肪酸組與培養(yǎng)溫度的相關(guān)性 279
五、討論 281
第三節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組與酸堿適應(yīng)的相關(guān)性 282
一、概述 282
二、研究方法 283
三、芽胞桿菌酸堿適應(yīng)性相關(guān)分析 283
四、芽胞桿菌酸堿適應(yīng)性回歸分析 283
五、芽胞桿菌酸堿適應(yīng)性聚類分析 288
六、芽胞桿菌酸堿適應(yīng)性判別分析 292
七、討論 295
第四節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組與溫度適應(yīng)的相關(guān)性 296
一、概述 296
二、研究方法 297
三、芽胞桿菌溫度適應(yīng)性相關(guān)分析 297
四、芽胞桿菌溫度適應(yīng)性回歸分析 298
五、芽胞桿菌溫度適應(yīng)性聚類分析 303
六、芽胞桿菌溫度適應(yīng)性判別分析 307
七、討論 310
第五節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組與鹽分適應(yīng)的相關(guān)性 312
一、概述 312
二、研究方法 313
三、芽胞桿菌鹽分適應(yīng)性相關(guān)分析 313
四、芽胞桿菌鹽分適應(yīng)性回歸分析 314
五、芽胞桿菌鹽分適應(yīng)性聚類分析 317
六、芽胞桿菌鹽分適應(yīng)性判別分析 323
七、討論 326
第六節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組與生理生化的相關(guān)性 328
一、概述 328
二、研究方法 328
三、芽胞桿菌生理生化指標(biāo)相關(guān)分析 329
四、芽胞桿菌生理生化指標(biāo)聚類分析 330
五、芽胞桿菌生理生化指標(biāo)主成分分析 337
六、芽胞桿菌生理生化指標(biāo)判別分析 338
七、討論 343
第四章 芽胞桿菌脂肪酸組生態(tài)學(xué)特性 346
**節(jié) 基于脂肪酸組微生物發(fā)酵床芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 346
一、概述 346
二、研究方法 346
三、基于脂肪酸微生物發(fā)酵床芽胞桿菌種群空間分布 347
四、基于脂肪酸微生物發(fā)酵床芽胞桿菌群落時(shí)間動(dòng)態(tài) 350
五、討論 353
第二節(jié) 基于脂肪酸組豬腸道芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 354
一、概述 354
二、研究方法 355
三、飼喂芽胞桿菌益生菌豬腸道微生物群落脂肪酸總量變化 356
四、飼喂芽胞桿菌益生菌豬腸道微生物群落脂肪酸生物標(biāo)記分布 356
五、飼喂芽胞桿菌益生菌豬腸道微生物群落脂肪酸生物標(biāo)記差異統(tǒng)計(jì) 358
六、飼喂芽胞桿菌益生菌豬腸道微生物群落脂肪酸生物標(biāo)記聚類分析 359
七、飼喂芽胞桿菌益生菌豬腸道微生物群落脂肪酸組多樣性指數(shù)分析 362
八、飼喂芽胞桿菌益生菌豬腸道芽胞桿菌群落脂肪酸生物標(biāo)記的變化動(dòng)態(tài) 363
九、飼喂芽胞桿菌益生菌對(duì)仔豬腸道微生物群落結(jié)構(gòu)及其生長(zhǎng)性能的影響 364
十、討論 367
第三節(jié) 基于脂肪酸組堆肥發(fā)酵芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 369
一、概述 369
二、研究方法 370
三、無(wú)致病力尖孢鐮刀菌堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 371
四、淡紫擬青霉堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 373
五、無(wú)致病力銅綠假單胞菌堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 375
六、凝結(jié)芽胞桿菌堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 377
七、短短芽胞桿菌堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 378
八、無(wú)致病力青枯雷爾氏菌堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 381
九、蠟樣芽胞桿菌堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 382
十、不接菌堆肥發(fā)酵組芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài) 384
十一、不同接種劑堆肥發(fā)酵芽胞桿菌群落動(dòng)態(tài)比較 386
十二、不同堆肥發(fā)酵組微生物群落脂肪酸總量累積值比較 387
十三、討論 389
第四節(jié) 基于脂肪酸組芽胞桿菌種群分化多樣性 389
一、概述 389
二、研究方法 392
三、基于脂肪酸組芽胞桿菌垂直分布種群分化多樣性 397
四、基于脂肪酸組芽胞桿菌水平分布種群分化多樣性 413
五、討論 443
第五章 芽胞桿菌脂肪酸組分類學(xué)特性 447
**節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組分布特性 447
一、概述 447
二、研究方法 447
三、芽胞桿菌脂肪酸組分布 448
四、芽胞桿菌種間脂肪酸組分群 456
五、芽胞桿菌屬間脂肪酸組分群 471
六、討論 483
第二節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組分群方法 487
一、概述 487
二、研究方法 488
三、芽胞桿菌脂肪酸分群生物標(biāo)記選擇 491
四、芽胞桿菌脂肪酸組多樣性指數(shù) 501
五、芽胞桿菌脂肪酸分群數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換方法比較 513
六、芽胞桿菌脂肪酸分群距離尺度選擇比較 537
七、討論 561
第三節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組系統(tǒng)分類 562
一、概述 562
二、研究方法 563
三、芽胞桿菌脂肪酸組種類鑒定 565
四、芽胞桿菌脂肪酸組系統(tǒng)進(jìn)化 571
五、討論 577
第四節(jié) 芽胞桿菌脂肪酸組新種鑒定 579
一、兵馬俑芽胞桿菌新種鑒定 579
二、仙草芽胞桿菌新種鑒定 591
三、慈湖芽胞桿菌新種鑒定 600
四、臺(tái)灣芽胞桿菌新種鑒定 608
五、武夷山芽胞桿菌新種鑒定 615
第五節(jié) 芽胞桿菌屬脂肪酸組系統(tǒng)發(fā)育 622
一、概述 622
二、研究方法 623
三、芽胞桿菌屬種類的脂肪酸組測(cè)定 627
四、芽胞桿菌屬種類的脂肪酸組特性 635
五、基于脂肪酸組芽胞桿菌屬系統(tǒng)發(fā)育 637
六、討論 642
第六章 芽胞桿菌脂肪酸組屬內(nèi)分群 647
**節(jié) 概述 647
第二節(jié) 芽胞桿菌屬脂肪酸群的劃分 648
一、芽胞桿菌屬脂肪酸組測(cè)定 648
二、芽胞桿菌主要脂肪酸數(shù)據(jù)矩陣構(gòu)建 651
三、芽胞桿菌屬的脂肪酸群 652
四、芽胞桿菌屬脂肪酸群的多樣性指數(shù) 657
第三節(jié) 類芽胞桿菌屬脂肪酸群的劃分 660
一、類芽胞桿菌屬脂肪酸組測(cè)定 660
二、類芽胞桿菌主要脂肪酸數(shù)據(jù)矩陣構(gòu)建 663
三、類芽胞桿菌屬的脂肪酸群 664
四、類芽胞桿菌屬脂肪酸群的多樣性指數(shù) 666
第四節(jié) 短芽胞桿菌屬脂肪酸群的劃分 667
一、短芽胞桿菌屬脂肪酸組測(cè)定 667
二、短芽胞桿菌主要脂肪酸數(shù)據(jù)矩陣構(gòu)建 671
三、短芽胞桿菌屬的脂肪酸群 672
四、短芽胞桿菌屬脂肪酸群多樣性指數(shù) 674
第五節(jié) 討論 675
第七章 芽胞桿菌脂肪酸組種下分型 677
**節(jié) 概述 677
第二節(jié) 芽胞桿菌屬脂肪酸種下分型 677
一、解淀粉芽胞桿菌脂肪酸型分析 677
二、萎縮芽胞桿菌脂肪酸型分析 683
三、嗜堿芽胞桿菌脂肪酸型分析 698
四、栗褐芽胞桿菌脂肪酸型分析 711
五、蠟樣芽胞桿菌脂肪酸型分析 716
六、環(huán)狀芽胞桿菌脂肪酸型分析 780
七、克氏芽胞桿菌脂肪酸型分析 785
八、遲緩芽胞桿菌脂肪酸型分析 791
九、地衣芽胞桿菌脂肪酸型分析 797
十、巨大芽胞桿菌脂肪酸型分析 806
十一、蕈狀芽胞桿菌脂肪酸型分析 844
十二、短小芽胞桿菌脂肪酸型分析 858
十三、簡(jiǎn)單芽胞桿菌脂肪酸型分析 875
十四、枯草芽胞桿菌脂肪酸型分析 882
十五、蘇云金芽胞桿菌脂肪酸型分析 916
十六、稠性芽胞桿菌脂肪酸型分析 921
第三節(jié) 短芽胞桿菌屬脂肪酸種下分型 936
一、千葉短芽胞桿菌脂肪酸型分析 936
二、副短短芽胞桿菌脂肪酸型分析 943
三、茹氏短芽胞桿菌脂肪酸型分析 950
第四節(jié) 類芽胞桿菌屬脂肪酸種下分型 957
一、幼蟲(chóng)類芽胞桿菌脂肪酸型分析 957
二、燦爛類芽胞桿菌脂肪酸型分析 961
三、慢病類芽胞桿菌脂肪酸型分析 966
四、浸麻類芽胞桿菌脂肪酸型分析 971
五、多黏類芽胞桿菌脂肪酸型分析 978
六、強(qiáng)壯類芽胞桿菌脂肪酸型分析 991
第五節(jié) 其他芽胞桿菌屬脂肪酸種下分型 999
一、乳酸芽胞乳桿菌脂肪酸型分析 999
二、泛酸枝芽胞桿菌脂肪酸型分析 1004
三、嗜熱噬脂肪地芽胞桿菌脂肪酸型分析 1013
四、紡錘形賴氨酸芽胞桿菌脂肪酸型分析 1020
五、球形賴氨酸芽胞桿菌脂肪酸型分析 1025
第