藍藻水華對湖泊細菌群落結(jié)構(gòu)的影響

目錄
第1章緒論 1
1.1問題的提出2
1.2分子生物學技術(shù)在湖泊細菌群落結(jié)構(gòu)組成研究中的應(yīng)用 3
1.2.1克隆文庫分析法（clone library profiling） 4
1.2.2遺傳指紋圖譜技術(shù)（genetic fingerprinting） 4
1.2.3分子雜交技術(shù)(molecular hybridization techniques) 6
1.3研究思路、技術(shù)路線和章節(jié)安排 6
1.3.1研究思路 6
1.3.2研究技術(shù)路線 7
1.3.3章節(jié)安排 7
第2章梅梁灣藍藻水華暴發(fā)過程中浮游細菌群落結(jié)構(gòu)多樣性的研究 9
2.1藍藻水華的暴發(fā)對細菌群落結(jié)構(gòu)組成存在潛在影響 9
2.2研究方法 10
2.2.1樣品的采集和預處理 10
2.2.2樣品的處理 11
2.2.3細菌基因組DNA的提取 11
2.2.4細菌群落結(jié)構(gòu)的T-RFLP分析 12
2.3研究結(jié)果 14
2.3.1理化指標的季節(jié)變化 14
2.3.2浮游藻類群藩結(jié)構(gòu)組成的季節(jié)性變化 18
2.3.3T-RFLP分析浮游細菌群落結(jié)構(gòu)的變化 19
2.3.4多元統(tǒng)計分析 21
2.4討論 24
2.4.1梅梁灣浮游藻類群落組成的時空差異及其原因 24
2.4.2梅梁灣浮游細菌群落組成的時空差異及其原因 25
2.5小結(jié) 26
第3章微囊藻水華堆積、分解過程中湖泊細菌群落結(jié)構(gòu)多樣性的實驗研究 27
3.1相關(guān)研究進展 27
3.2研究方法 28
3.2.1實驗設(shè)計 28
3.2.2樣品的采集和預處理 28
3.2.3理化指標的測定 29
3.2.4細菌計數(shù) 29
3.2.5細菌基因組DNA的提取 30
3.2.6細菌群落結(jié)構(gòu)的T-RFLP分析 30
3.2.7克隆建庫、測序、系統(tǒng)進化分析、確定T-RFs所屬細菌菌群 30
3.2.8統(tǒng)計分析 32
3.3研究結(jié)果 32
3.3.1理化指標的變化 32
3.3.2細菌數(shù)量的變化 34
3.3.3T-RFLP分析浮游細菌群落結(jié)構(gòu)的變化 34
3.3.4T-RFLP分析附著細菌群落結(jié)構(gòu)的變化 36
3.3.5系統(tǒng)發(fā)育分析、確定T-RFs所屬細菌菌群 37
3.3.6細菌群落結(jié)構(gòu)變化與環(huán)境因子間的相關(guān)分析 47
3.4討論 49
3.4.1水華微囊藻分解過程中細菌數(shù)目和群落結(jié)構(gòu)組成的變化 49
3.4.2永華微囊藻分解過程中放線菌成為優(yōu)勢種群 50
3.4.3水華微囊藻堆積、分解過程中軍團茵大量出現(xiàn) 51
3.5小結(jié)51
第4章微囊藻水華干擾后浮游細菌群落結(jié)構(gòu)的恢復性研究 52
4.1微囊藻水華干擾后浮游細菌群落結(jié)構(gòu)的恢復性研究的重要性 52
4.2研究方法 53
4.2.1實驗設(shè)計53
4.2.2樣品的采集和預處理 53
4.2.3樣品的處理54
4.2.4浮游細菌基因組DNA的提取 55
4.2.5浮游細菌群落結(jié)構(gòu)PCR-DGGE分析 55
4.2.6克隆文庫的構(gòu)建、構(gòu)建系統(tǒng)進化樹 56
4.2.7統(tǒng)計分析 56
4.3研究結(jié)果 57
4.3.1各圍隔中理化環(huán)境因子的變化 57
4.3.2PCR-DGGE分析的浮游細菌群落結(jié)構(gòu)變化 59
4.3.316 S rDNA克隆文庫分析的浮游細菌群落結(jié)構(gòu)變化 61
4.3.4浮游細菌群落與環(huán)境因子的相關(guān)分析 67
4.4討論 68
4.4.1高存量藍藻水華堆積、分解、消退過程中水體理化環(huán)境因子
的變化 69
4.4.2高存量藍藻水華堆積、分解過程中浮游細菌群落結(jié)構(gòu)的變化 69
4.4.3高存量藍藻水華消退后浮游細菌群落結(jié)構(gòu)的恢復性分析 70
4.5小結(jié) 71
第5章藻源性湖泛發(fā)生過程中細菌群落結(jié)構(gòu)組成研究 72
5.1引言72
5.2研究方法 73
5.2.1樣點設(shè)置和樣品采集 73
5.2.2細菌基因組DNA的提取 74
5.2.3細菌群落結(jié)構(gòu)的T-RFLP分析 74
5.2.4克隆文庫的構(gòu)建 74
5.2.5陶性克隆的篩選、測序 75
5.2.6序列分析、構(gòu)建進化樹、確定T-RFs所屬細菌茵群 75
5.2.7統(tǒng)計分析 75
5.3研究結(jié)果 76
5.3.1藻源性湖泛發(fā)生過程中水體理化因子變化 76
5.3.2藻源性湖泛發(fā)生過程中細菌群落多樣性指數(shù)的變化 78
5.3.3T-RFLP分析浮游細菌群落結(jié)構(gòu)的變化 79
5.3.4T-RFLP分析附著細菌群落結(jié)構(gòu)的變化 82
5.3.5系統(tǒng)發(fā)育分析、確定T-RFs所屬細菌菌群 83
5.4討論 92
5.4.1太湖藻源性湖泛發(fā)生過程中水體理化環(huán)境因子的變化 92
5.4.2太湖藻源性湖泛發(fā)生過程中水體細菌群落結(jié)構(gòu)組成 93
5.4.3太湖藻源性湖泛發(fā)生過程中水體細菌群落結(jié)構(gòu)的空間異質(zhì)性 94
5.5小結(jié) 94
參考文獻 96