生物信息學學習指導及習題集（八年制配教）

第一章 生物序列資源
學習目標
知識要點
一、引言
二、NCBI數(shù)據(jù)庫與數(shù)據(jù)資源
三、LICSC基因組瀏覽器與數(shù)據(jù)資源
四、EMBL-EBI數(shù)據(jù)庫與數(shù)據(jù)資源
五、重要的非編碼基因數(shù)據(jù)庫
復習思考題
一、名詞解釋
二、問答題
答案與題解
第二章 序列比對
學習目標
知識要點
一、引言
二、比對算法概要
三、數(shù)據(jù)庫搜索
四、比對軟件、參數(shù)與數(shù)據(jù)資源
五、比對技術(shù)的發(fā)展
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第三章 序列特征分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、DNA序列特征分析
三、蛋白質(zhì)序列特征分析
四、RNA序列與結(jié)構(gòu)特征分析
五、表達序列特征分析
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第四章 分子進化分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、系統(tǒng)發(fā)生樹分析與重建
三、核苷酸和蛋白質(zhì)的適應性進化
四、分子進化與生物信息學
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、計算題
答案與題解
第五章 基因芯片數(shù)據(jù)分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、基因表達的測定平臺、數(shù)據(jù)庫
三、數(shù)據(jù)的預處理、差異表達分析
四、基因芯片數(shù)據(jù)的聚類或分類分析
五、基因表達分析的常用軟件
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、上機實踐
答案與題解
第六章 蛋白質(zhì)組與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)的獲取與分析
三、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的預測
四、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫
五、蛋白質(zhì)功能分析
六、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)異常與疾病
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第七章 基因注釋與功能分類
學習目標
知識要點
一、引言
二、基因注釋數(shù)據(jù)庫
三、基因集功能富集分析
四、基因功能預測
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、上機實踐
答案與題解
第八章 轉(zhuǎn)錄調(diào)控的信息學分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點的信息學預測方法
三、轉(zhuǎn)錄調(diào)控相關(guān)數(shù)據(jù)庫
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第九章 生物分子網(wǎng)絡和通路
學習目標
知識要點
一、生物分子網(wǎng)絡概述
二、生物分子網(wǎng)絡分析
三、生物分子網(wǎng)絡重構(gòu)
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第十章 計算表觀遺傳學
學習要點
內(nèi)容要點
一、引言
二、基因組的DNA甲基化
三、組蛋白修飾的表觀基因組
四、基因組印記
五、表觀遺傳學數(shù)據(jù)庫和軟件
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
答案與題解
第十一章 復雜疾病的分子特征與計算分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、復雜疾病的分子特征與數(shù)據(jù)資源
三、復雜疾病的遺傳易感與遺傳定位分析
四、常用的集成軟件工具
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第十二章 非編碼RNA與復雜疾病
學習目標
知識要點
一、miRNA的特點及作用機制
二、miRNA靶基因預測
三、IncRNA及作用機制
四、ncRNA主要數(shù)據(jù)資源
五、ncRNA多態(tài)性分析
六、利用ncRNA表達譜研究復雜疾病
七、復雜疾病非編碼RNA的計算識別
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、上機實踐
答案與題解
第十三章 新一代測序技術(shù)與復雜疾病研究
學習目標
知識要點
一、引言
二、新一代測序技術(shù)概述
三、DNA測序技術(shù)及應用
四、RNA測序技術(shù)與數(shù)據(jù)分析
五、ChIP-seq技術(shù)原理及分析方法
六、新一代測序技術(shù)在其他領域應用
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第十四章 藥物生物信息學
學習目標
知識要點
一、引言
二、藥物靶標的信息學識別
三、藥物基因組學及其臨床研究策略
四、藥物基因組相關(guān)生物信息資源
五、基于藥物基因組的個體化藥物治療
復習思考題
一、名詞解釋
二、選擇題
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解