生物信息學(xué)中計算機技術(shù)應(yīng)用

第1章 緒論
1.1 引言
1.2 生物信息學(xué)
1.2.1 生物信息學(xué)產(chǎn)生的背景
1.2.2 生物學(xué)數(shù)據(jù)庫
1.2.3 生物信息學(xué)的主要研究內(nèi)容
1.2.4 與生物信息學(xué)關(guān)系密切的數(shù)學(xué)領(lǐng)域
1.2.5 與生物信息學(xué)密切相關(guān)的計算機科學(xué)技術(shù)
1.2.6 生物信息學(xué)工業(yè)
1.3 生物信息學(xué)中的計算機技術(shù)應(yīng)用
1.4 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模型
1.5 生物系統(tǒng)背景知識
1.6 本書研究的內(nèi)容
1.7 本書的組織結(jié)構(gòu)
1.8 本章小結(jié)
第2章 、生物信息學(xué)中的結(jié)構(gòu)比較
2.1 結(jié)構(gòu)比對
2.2 VAST與DALI
2.3 全局與局部結(jié)構(gòu)比較
2.4 利用數(shù)學(xué)記號進行結(jié)構(gòu)比較
2.5 生物大分子表面結(jié)構(gòu)的比較
2.6 本章小結(jié)
第3章 三維結(jié)構(gòu)比較
3.1 三維結(jié)構(gòu)比較研究
3.2 基于體模型的比較
3.2.1 外形特點分析
3.2.2 特征提取與匹配
3.3 基于三維模型幾何相似性的比較
3.3.1 基于輪廓的幾何相似性比較算法
3.3.2 基于拓撲結(jié)構(gòu)的幾何相似性比較算法
3.3.3 基于視覺的幾何相似性比較算法
3.4 三維模型相似性度量方法的分類
3.5 本章小結(jié)
第4章 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)可視化
4.1 蛋白質(zhì)存儲結(jié)構(gòu)分析
4.2 PDB文件中對于大分子結(jié)構(gòu)的描述
4.3 MATLAB下蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)可視化實現(xiàn)
4.4.本章小結(jié)
第5章 建立蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)頻譜
5.1 三維物體形狀特征提取
5.2 統(tǒng)一坐標(biāo)系的建立
5.3 小波分析
5.4 基于蛋白質(zhì)
5.5 基于統(tǒng)一坐標(biāo)序列的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)多分辨頻譜建立
5.6 本章小結(jié)
第6章 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相似性
6.1 三維模型相似性比較
6.2 灰色系統(tǒng)理論概述
6.3 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相似性的灰色關(guān)聯(lián)分析
6.3.1 原理與方法
6.3.2 實驗結(jié)果及討論
6.4 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)頻譜的灰色關(guān)聯(lián)分析
6.4.1 方法與步驟
6.4.2 實驗結(jié)果及討論
6.5 本章小結(jié)
第7章 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)空間復(fù)雜性
7.1 生物學(xué)中的分形
7.2 分形的概述
7.3 基于分形的蛋白質(zhì)三維空間結(jié)構(gòu)復(fù)雜性研究
7.3.1 原子覆蓋法的碳骨架分維數(shù)計算
7.3.2 實驗結(jié)果及討論
7.4 基于結(jié)構(gòu)頻譜分維的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)相似性比較
7.4.1 方法與步驟
7.4.2 實驗結(jié)果及討論
7.5 本章小結(jié)
第8章 蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu)視圖系統(tǒng)
8.1 系統(tǒng)框架
8.2 系統(tǒng)功能
8.3 本章小結(jié)
后記
參考文獻