微生物生態(tài)學導論

第一章 生態(tài)學與微生物生態(tài)學
第一節(jié) 生態(tài)學
一、生態(tài)學定義
二、生態(tài)學研究內(nèi)容
三、生態(tài)學分類
四、生態(tài)學的發(fā)展
第二節(jié) 微生物生態(tài)學
一、微生物生態(tài)學的定義
二、微生物生態(tài)學的研究范圍
三、微生物生態(tài)學的任務(wù)
四、微生物生態(tài)學的發(fā)展
五、微生物生態(tài)學與其他學科的關(guān)系
第二章 微生物生態(tài)學的基本原理
第一節(jié) 環(huán)境與微環(huán)境
一、環(huán)境
二、生境
三、生態(tài)位
四、微環(huán)境
五、表面環(huán)境
第二節(jié) 生物圈和生態(tài)系統(tǒng)
一、生物圈
二、生態(tài)系統(tǒng)
三、微生物生態(tài)系統(tǒng)
第三節(jié) 生態(tài)系統(tǒng)的功能
一、物種流
二、能量流
三、食物鏈
四、營養(yǎng)級
五、信息流
第三章 自然界中的微生物及其多樣性
第一節(jié) 微生物在土壤中的分布
一、土壤的形成
二、土壤的環(huán)境條件
三、土壤中微生物的生態(tài)分布
第二節(jié) 微生物在水體中的分布
一、清水型與腐敗型水生微生物
二、淡水微生物和海水微生物
三、水中微生物的作用
四、水中的微生物與飲用水
第三節(jié) 微生物在大氣中的分布
第四節(jié) 工農(nóng)業(yè)產(chǎn)品中的微生物
一、糧食和食品中的微生物
二、肉類上的微生物
三、魚類上的微生物
四、乳制品中的微生物
五、工業(yè)材料及其制品中的微生物
第五節(jié) 生物圈中的第四大生命域
第四章 極端環(huán)境中的微生物
第一節(jié) 嗜熱微生物和嗜冷微生物
一、嗜熱微生物
二、嗜冷微生物
第二節(jié) 嗜酸微生物和嗜堿微生物
一、嗜酸微生物
二、嗜堿微生物
第三節(jié) 其他嗜極微生物
一、嗜鹽微生物
二、嗜壓微生物
三、抗輻射微生物
四、太空微生物
第四節(jié) 嗜極微生物的開發(fā)利用
第五章 微生物種群增長與相互作用
第一節(jié) 種群的基本概念
一、種群的定義
二、種群密度
三、種群相互作用
第二節(jié) 種群增長
一、微生物在封閉環(huán)境內(nèi)的增長
二、微生物在開放環(huán)境內(nèi)的增長
第三節(jié) 種群之間的相互作用
一、相互作用的基本類型
二、種群之間競爭的動力學原理
第六章 微生物群落發(fā)展與演替
第一節(jié) 群落的基本概念
一、群落定義
二、群落形成
第二節(jié) 群落的主要特征
一、種多樣性
二、垂直結(jié)構(gòu)
三、優(yōu)勢種
四、群落生境
第三節(jié) 群落的發(fā)展和演替
一、微生物種群的適應作用和自然選擇
二、微生物群落的發(fā)展
三、微生物群落的演替
第七章 微生物與生物地球化學循環(huán)
第一節(jié) 有機物的微生物降解
一、微生物在生態(tài)系統(tǒng)中的作用
二、有機物降解的重要性
第二節(jié)碳素循環(huán)
一、含碳化合物的主要來源
二、碳在食物網(wǎng)中的轉(zhuǎn)移
三、生境中的碳循環(huán)
四、自然多聚物的微生物降解
五、微生物與全球性的碳循環(huán)
第三節(jié) 氮素循環(huán)
一、硝化作用
二、硝酸還原作用和反硝化作用
三、固氮作用
四、環(huán)境和農(nóng)業(yè)活動對氮素循環(huán)的影響
第四節(jié) 其他元素的循環(huán)
一、氧循環(huán)
二、氫循環(huán)
三、硫循環(huán)
四、磷循環(huán)
五、鐵循環(huán)
六、硅循環(huán)
第八章 環(huán)境因子對微生物的影響
第一節(jié) 營養(yǎng)因子對微生物的影響
一、最小量定律
二、營養(yǎng)因子及其生理作用
第二節(jié) 物理因子對微生物的影響
一、溫度
二、水分活度
三、滲透壓
四、輻射
五、超聲波
六、微波
七、壓力
第三節(jié) 化學因子對微生物的影響
——、pH
二、Eh
三、化學物質(zhì)
第九章 微生物與動植物的相互關(guān)系
第一節(jié) 微生物與植物之間的相互關(guān)系
一、植物表面微生物
二、植物與微生物的共生體
三、微生物引起的植物病害
第二節(jié) 微生物與動物之間的相互關(guān)系
一、微生物與昆蟲的共生
二、瘤胃共生
三、發(fā)光細菌和海洋魚類的共生
四、光合微生物與無脊椎動物的共生
五、動物與微生物的捕食關(guān)系
六、動物致病的某些生態(tài)學問題
第三節(jié) 微生物與人體之間的相互關(guān)系
一、微生物與皮膚健康
二、微生物與口腔健康
三、微生物與胃腸道健康
第十章 微生物生態(tài)學研究的方法和技術(shù)
第一節(jié) 經(jīng)典方法和技術(shù)
一、樣品的采集、富集培養(yǎng)和微生物的純培養(yǎng)的分離
二、顯微計數(shù)法和熒光染色直接計數(shù)法
三、最大近似值法
四、活菌計數(shù)法
第二節(jié) 生理生化方法
一、Biolog微平板法
二、PLFA譜圖分析
第三節(jié) 分子生物學方法
一、(G+c)摩爾百分含量
二、核酸探針雜交技術(shù)
三、DNA—DNA雜交
四、基于PcR的指紋圖譜分析
五、DNA序列分析
六、基因芯片
七、宏基因組學
第十一章 微生物分子生態(tài)學
第一節(jié) 微生物分子生態(tài)學的由來
一、自然種群結(jié)構(gòu)鑒定的普遍性問題
二、利用遺傳信息鑒定微生物種群的可行性
第二節(jié) 自然種群鑒定的策略
一、單細胞的直接鑒定
二、從自然樣品中抽提細胞
三、從自然樣品中直接抽提核酸
第三節(jié) 微生物分子生態(tài)學研究方法的優(yōu)勢和不足
一、微生物分子生態(tài)學研究方法的優(yōu)勢
二、微生物分子生態(tài)學研究方法的不足
三、展望
第十二章 微生物生態(tài)學的應用
第一節(jié) 農(nóng)業(yè)微生物生態(tài)學及其應用
一、作物根系環(huán)境的微生物區(qū)系
二、土壤微生物的生態(tài)功能
第二節(jié) 醫(yī)學微生物生態(tài)學及其應用
一、口腔生境特點和微生物
二、胃腸道微生物和人體健康
第三節(jié) 水生微生物生態(tài)學及其應用
一、水體基本特性
二、水體中的微生物區(qū)系
三、水體微生物的作用
第十三章 微生態(tài)學與微生態(tài)制劑
第一節(jié) 微生態(tài)學的概念
第二節(jié) 微生態(tài)學的創(chuàng)立與發(fā)展
第三節(jié) 正常微生物群及其與宿主的關(guān)系
一、正常微生物群
二、正常微生物群與人和動物的關(guān)系
第四節(jié) 微生態(tài)學與微生態(tài)制劑
一、微生態(tài)制劑的含義和類型
二、微生態(tài)制劑的作用機制
參考文獻