生物信息學(xué)算法導(dǎo)論

定　價：￥45.00

作　者：	（美）N.C.瓊斯、（美）P.A.帕夫納
出版社：	化學(xué)工業(yè)出版社
叢編項：
標(biāo)　簽：	生物工程學(xué)

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ISBN：	9787122001696	出版時間：	2007-07-01	包裝：	平裝
開本：	16	頁數(shù)：	345	字?jǐn)?shù)：

內(nèi)容簡介

　　這是一本關(guān)于生物信息學(xué)算法和計算思想的導(dǎo)論性教科書，原著由國際上的權(quán)威學(xué)者撰寫，經(jīng)國內(nèi)知名專家精心翻譯為中文，系統(tǒng)介紹推動生物信息學(xué)不斷進(jìn)步的算法原理。全書強(qiáng)調(diào)的是算法中思想的運(yùn)用，而不是對表面上并不相關(guān)的各類問題進(jìn)行簡單的堆砌。體現(xiàn)了以下特色：闡述生物學(xué)中的相關(guān)問題，涉及對問題的模型化處理并提供一種或多種解決方案：簡要介紹生物信息學(xué)領(lǐng)域領(lǐng)軍人物；饒有趣味的小插圖使得概念更加具體和形象，方法更容易被領(lǐng)會，激勵學(xué)生學(xué)習(xí)的興趣并鼓勵他們加入到生物信息學(xué)研究工作中來。書中的大量論述表明：較少的幾種設(shè)計思想就能解決大量的生物學(xué)難題。目前，可供本科學(xué)生使用的生物信息學(xué)著作為數(shù)不多，本書恰恰是其中的一本。國內(nèi)生物信息學(xué)，計算生物學(xué)、計算數(shù)學(xué)等領(lǐng)域的本科生、研究生和其他研究人員，會從書中汲取基本的算法原理、解決實際問題的方法和技巧，進(jìn)而更好地從事相關(guān)研究工作。

作者簡介

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圖書目錄

1緒論1
2算法與復(fù)雜性6
21算法是什么？6
22生物學(xué)算法與計算機(jī)算法11
23找錢問題14
24正確的與錯誤的算法17
25遞歸算法20
26迭代算法與遞歸算法的比較24
27快速算法與慢速算法的比較28
28大O記號30
29算法設(shè)計技術(shù)33
210易處理與不易處理問題的比較39
211附注41
人物天地：Richard Karp42
212問題44
3分子生物學(xué)簡介47
31生命是由什么組成的？47
32什么是遺傳物質(zhì)？48
33基因是干什么的？49
34哪些分子編碼基因？50
35DNA的結(jié)構(gòu)是怎樣的？51
36在DNA和蛋白質(zhì)間傳遞信息的物質(zhì)是什么？52
37蛋白質(zhì)是由什么組成的？53
38我們該如何去分析DNA？55
39一個物種的個體差異是怎樣產(chǎn)生的？59
310不同物種間有怎樣的差異？60
311為什么要搞生物信息學(xué)？61
人物天地：Russell F.Doolittle64
4窮舉搜索67
41限制酶切作圖67
42不實用的限制酶切作圖算法71
43一個實用的限制酶切作圖算法72
44DNA序列上的調(diào)控基序74
45序列剖面76
46基序發(fā)現(xiàn)問題79
47檢索樹81
48發(fā)現(xiàn)基序88
49發(fā)現(xiàn)一個中間字符串90
410附注93
人物天地：Gary Stormo95
411問題97
5貪婪算法101
51基因組重排101
52反序排序法103
53近似算法105
54斷點：貪婪的另一面106
55 貪婪方法與基序發(fā)現(xiàn)109
56附注111
人物天地：David Sankoff112
57問題115
6動態(tài)規(guī)劃算法118
61DNA序列比較的力量118
62找錢問題重述119
63曼哈頓游客問題122
64編輯距離與聯(lián)配132
65最長共同子序列136
66全局序列聯(lián)配140
67得分聯(lián)配141
68局部序列聯(lián)配142
69缺口罰分聯(lián)配145
610多重聯(lián)配146
611基因預(yù)測151
612基因預(yù)測的統(tǒng)計方法154
613基于相似性的基因預(yù)測方法156
614剪接聯(lián)配158
615附注162
人物天地：Michael Waterman163
616問題165
7分而治之算法178
71排序問題的分治法178
72空間效率高的序列聯(lián)配181
73模序聯(lián)配和四個俄羅斯人的加速法184
74在亞二次時間內(nèi)構(gòu)建聯(lián)配187
75附注188
人物天地：Webb Miller189
76問題192
8圖算法194
81圖194
82圖與遺傳學(xué)202
83DNA測序204
84最短超字符串問題205
85作為可選擇測序技術(shù)的DNA陣列207
86雜交測序209
87SBH與Hamilton路問題210
88SBH與歐拉路問題211
89DNA測序中的片段裝配214
810蛋白質(zhì)測序和鑒定217
811肽測序問題220
812譜圖222
813基于數(shù)據(jù)庫搜索的蛋白質(zhì)鑒定224
814譜的卷積226
815譜聯(lián)配228
816附注232
817問題234
9組合模式匹配241
91重復(fù)序列發(fā)現(xiàn)241
92哈希表242
93精確模式匹配245
94關(guān)鍵詞樹247
95后綴樹249
96啟發(fā)式相似性搜索算法251
97近似模式匹配253
98BLAST：依靠數(shù)據(jù)庫的序列比較256
99附注257
人物天地：Gene Myers258
910問題261
10聚類和樹263
101基因表達(dá)分析263
102系統(tǒng)聚類265
103k均值聚類268
104聚類和有瑕團(tuán)270
105進(jìn)化樹274
106基于距離的樹重構(gòu)277
107由可加矩陣重構(gòu)樹279
108進(jìn)化樹與系統(tǒng)聚類283
109基于字符的樹重構(gòu)285
1010小簡約問題286
1011大簡約問題290
1012附注292
人物天地：Ron Shamir294
1013問題297
11隱馬氏模型299
111CG島和“公平賭場”299
112公平賭場和隱馬氏模型301
113解碼算法304
114隱馬氏模型參數(shù)估計306
115剖面隱馬氏模型聯(lián)配307
116附注310
人物天地：David Haussler311
117問題314
12隨機(jī)化算法316
121排序問題回顧316
122吉布斯抽樣318
123隨機(jī)投影320
124附注322
125問題323
參考文獻(xiàn)325
索引332