染色質與表觀遺傳調控

第一章 染色質的結構與功能
第一節(jié) 染色質的基本結構
一、染色質的基本單位——核小體
二、核小體的裝配與相位
三、染色質高級結構
第二節(jié) 染色質結構域及其相關元件
一、染色質的結構域效應
二、染色質元件及其結合蛋白
第三節(jié) 染色質的修飾與結構重塑
一、染色質的修飾及其意義
二、染色質高級結構的分類和修飾特征
第四節(jié) 染色質與表觀遺傳調控網絡
結束語
參考文獻
第二章 核心組蛋白的修飾
第一節(jié) 組蛋白密碼
一、組蛋白修飾與基因轉錄調控
二、組蛋白修飾的生理與病理意義
第二節(jié) 組蛋白乙?；揎?br /> 一、組蛋白乙?；D移酶
二、天然核小體乙酰化復合物
三、組蛋白乙酰基轉移酶和FAT
四、組蛋白去乙酰基酶
第三節(jié) 組蛋白甲基化修飾
一、組蛋白賴氨酸甲基化
二、組蛋白精氨酸甲基化
三、組蛋白去甲基化
第四節(jié) 組蛋白磷酸化
一、組蛋白H3磷酸化
二、組蛋白H2B磷酸化
三、組蛋白H2A和組蛋白H4的磷酸化
第五節(jié) 組蛋白其他類型修飾
一、組蛋白泛素化修飾
二、組蛋白SUMO化修飾
三、組蛋白生物素化修飾
第六節(jié) 組蛋白修飾的網絡
一、組蛋白修飾的順式相互作用
二、組蛋白修飾的反式相互作用
三、組蛋白甲基化與DNA甲基化之間的相互作用
結束語
參考文獻
第三章 依賴于ATP的染色質重塑復合物
第一節(jié) 概述
一、染色質重塑復合物的組成
二、染色質重塑復合物的作用機制
三、染色質重塑復合物對基因轉錄的激活作用
四、染色質重塑復合物參與抑制基因的轉錄
第二節(jié) SWI／SNF復合物家族
一、SWI／SNF復合物家族的組成
二、SWI／SNF復合物的結構域及功能
三、不同的SWI／SNF復合物提供特定的功能
第三節(jié) ISWI復合物家族
一、ISWI復合物的功能
二、種類繁多的ISWI復合物
第四節(jié) Mi-2復合物家族
一、Mi-2的功能特異性
二、MBD2、MBD3與DNA甲基化
三、MTA蛋白家族與Mi-2／NuRD的功能特異性
第五節(jié) Ino80和SWRl染色質重塑復合物
一、lno80和SWRl重塑復合物的亞基組成
二、參與組蛋白的交換
三、參與DNA損傷斷裂修復
第六節(jié) ATP依賴的染色質重塑復合物與其他染色質重塑機制的聯系
一、重塑機制協(xié)同激活轉錄
二、重塑機制協(xié)同抑制轉錄
結束語
參考文獻
第四章 真核基因組DNA的甲基化修飾
第一節(jié) 甲基化的基本概念
一、原核生物甲基化現象
二、真核生物胞嘧啶甲基化
第二節(jié) DNA甲基化對真核基因表達調控的作用
一、DNMT家族介導轉錄抑制活性
二、MBD家族介導的轉錄阻遏機制
三、DNA甲基化排斥轉錄因子
四、DNA甲基化和組蛋白修飾協(xié)同參與轉錄調控
第三節(jié) DNA甲基化在重大生命活動中的調控作用
一、DNA甲基化在重要生理活動中的調控作用
二、DNA甲基化在疾病中的調控作用
第四節(jié) 甲基轉移酶抑制劑在腫瘤治療中的作用
結束語
參考文獻
第五章 RNA與染色質
第一節(jié) RNA干擾及其機制
一、RNA干擾的轉錄后沉默
二、siRNAs與miRNAs的聯系和區(qū)別
第二節(jié) RNAi介導的轉錄水平沉默
一、RNA指導的DNA甲基化
二、依賴RNAi的異染色質形成
第三節(jié) RNA干擾的應用
一、RNA干擾在基因功能研究上的應用
二、RNA干擾在醫(yī)藥科學上的研究及應用前景
結束語
參考文獻
附錄 輔助閱讀材料
一、染色質免疫沉淀分析
二、全基因組定位技術
三、核小體相位分析
四、染色質DNA酶I高敏感位點的檢測
五、體內DNA足跡法
六、體外染色質裝配
七、分離組蛋白變異體及修飾異構體
八、電泳遷移率變更檢測法
九、DNA甲基化檢測方法
十、RNA干擾技術
十一、染色質構象捕獲技術
索引