蛋白質工程

第一章 蛋白質結構基礎
　第一節(jié) 蛋白質結構的基本組件
　　一、20種天然常見氨基酸
　　二、肽單位和多肽鏈
　　三、α螺旋
　　四、β層
　　五、環(huán)肽鏈
　　六、疏水內核
　第二節(jié) 蛋白質結構的組織和主要類型
　　一、蛋白質結構的層次體系
　　二、蛋白質結構分類
　　三、三類主要蛋白質結構
　第三節(jié) 蛋白質結構的形成多肽鏈的生物合成與折疊
　　一、多肽鏈的生物合成
　　二、多肽鏈的折疊蛋白質三維結構的形成
　　三、蛋白質結構與蛋白質工程
　參考文獻
第二章 蛋白質分子設計
　第一節(jié) 基于天然蛋白質結構的分子設計
　　一、概述
　　二、蛋白質設計原理
　　三、蛋白質設計中的結構功能關系研究
　　四、天然蛋白質的剪裁
　第二節(jié) 全新蛋白質設計
　　一、引言
　　二、蛋白質結構的從頭設計
　　三、蛋白質的功能設計
　第三節(jié) 計算蛋白質設計
　　一、能量表達
　　二、能量優(yōu)化
　　三、序列優(yōu)化
　　四、序列－結構專一性
　　五、底物專一性設計
　　六、金屬結合位點的設計
　參考文獻
第三章 蛋白質的修飾和表達
　第一節(jié) 蛋白質修飾的化學途徑
　　一、功能基團的特異性修飾
　　二、基于蛋白質片段的嵌合修飾
　第二節(jié) 蛋白質改造的分子生物學途徑
　　一、編碼基因的專一性位點和區(qū)域性定向突變
　　二、基因融合和基因剪接
　　三、tRNA介導定點攙入非天然氨基酸
　第三節(jié) 重組蛋白質的表達
　　一、目標蛋白質在大腸桿菌中的表達
　　二、目標蛋白質在酵母細胞中的表達
　　三、重組蛋白質在哺乳動物細胞中的表達
　　四、噬菌體顯示
　參考文獻
第四章 突變蛋白質的物理化學性質分析
　第一節(jié) 蛋白質溶液的熱力學
　　一、熱運動與蛋白質構象
　　二、熱力學函數(shù)與熱力學平衡
　　三、熱容量
　　四、van’t Hoff焓
　　五、折疊/退折疊轉變
　　六、量熱法與折疊過程熱力學
　第二節(jié) 蛋白質折疊動理學
　　一、折疊動理研究技術
　　二、兩態(tài)動理
　　三、過渡態(tài)
　　四、折疊中間態(tài)
　　五、折疊的基本過程
　第三節(jié) 突變、穩(wěn)定性和折疊
　　一、熱力學參數(shù)在分子水平上的解釋
　　二、突變與熱穩(wěn)定性
　　三、突變與折疊過程
　參考文獻
第五章 天然和重組蛋白質結構測定
　第一節(jié) X射線晶體結構分析
　　一、概念基本原理
　　二、蛋白質結晶和晶體生長
　　三、衍射數(shù)據(jù)收集
　　四、確定位相
　　五、電子密度圖詮釋
　　六、結構模型精化
　參考文獻
　第二節(jié) 核磁共振波譜的溶液結構解析
　　一、概述蛋白質溶液三級結構測定
　　二、基本的多維核磁共振實驗
　　三、多維核磁共振波譜解析簡介
　參考文獻
　第三節(jié) 蛋白質結構預測
　　一、蛋白質結構預測方法準確性的評估
　　二、序列相似性對比
　　三、蛋白質二級結構預測
　　四、蛋白質三級結構預測
　　五、蛋白質結構預測與藥物設計
　　六、蛋白質數(shù)據(jù)庫
　參考文獻
第六章 蛋白質工程在醫(yī)藥工業(yè)中的應用
　第一節(jié) 醫(yī)用抗體的蛋白質工程
　　一、抗體的產生和抗體的結構簡介
　　二、從抗血清到重組抗體
　　三、抗體工程
　第二節(jié) 組織纖維蛋白溶酶原激活因子的蛋白質工程
　　一、有關重組t－PA
　　二、產生t－PA突變體的基本原理
　　三、t－PA蛋白質工程的幾個方面
　第三節(jié) 基于蛋白質結構的小分子藥物設計
　　一、用DOCK發(fā)現(xiàn)先導化合物252
　　二、Haloperidol衍生物對HIV－1 PR的抑制
中西文名詞對照